Управление Станцией строится на принципах единоначалия и коллегиальности. Коллегиальными органами Станции является: общее собрание работников Станции, Попечительский Совет, Педагогический совет.
Единоличным исполнительным органом Станции является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью Станции.
Директор — Кащеев Артем Александрович.